Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIRAP54198 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HIRAP54198 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIRAP54198 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIRAP54198 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIRAP54198 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIRAP54198 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIRAP54198 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms