Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms