Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGAEP38570 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGAEP38570 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms