Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LTBRP36941 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms