Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms