Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNB1P35222 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms