Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms