Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMBRP28336 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMBRP28336 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMBRP28336 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMBRP28336 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMBRP28336 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMBRP28336 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMBRP28336 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NMBRP28336 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMBRP28336 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMBRP28336 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMBRP28336 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms