Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA2P26232 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms