Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMO2P25791 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMO2P25791 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMO2P25791 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms