Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2AP24928 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2AP24928 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms