Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRGP23470 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRGP23470 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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