Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms