Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG2P13727 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRG2P13727 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms