Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms