Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BMP4P12644 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BMP4P12644 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms