Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DMDP11532 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DMDP11532 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DMDP11532 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DMDP11532 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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