Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms