Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GLI2P10070 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
GLI2P10070 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GLI2P10070 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GLI2P10070 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GLI2P10070 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms