Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C8orf88P0DMB2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms