Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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