Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOA4P06727 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOA4P06727 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOA4P06727 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOA4P06727 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOA4P06727 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOA4P06727 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms