Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms