Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNSO60931 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNSO60931 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms