Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNC1O60486 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms