Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NDUFS4O43181 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDUFS4O43181 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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