Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNJ2O15056 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms