Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SETD1AO15047 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD1AO15047 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms