Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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