Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRTO14522 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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