Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EBAG9O00559 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EBAG9O00559 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms