Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRRT4C9JH25 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms