Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PATL2C9JE40 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms