Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGPD3A6NKT7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGPD3A6NKT7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms