Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms