Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCP1A6NGW2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms