Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAB39Q9Y376 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms