Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms