Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLR1DQ9Y2S0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms