Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM2AQ9Y2K7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM2AQ9Y2K7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms