Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF6Q9Y252 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms