Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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