Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FBXL4Q9UKA2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms