Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms