Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms