Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms