Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DKK3Q9UBP4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DKK3Q9UBP4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms