Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USP36Q9P275 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms