Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHRF1Q9P1Y6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms