Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms